雖然尿結(jié)石的形成與代謝紊亂兩者之間的關(guān)系仍無最終結(jié)論，但是經(jīng)過醫(yī)學科研人員多年的研究認為鈣磷代謝紊亂可引發(fā)：高鈣尿、高草酸尿、高尿酸尿、胱氨酸尿、黃嘌呤尿、低枸櫞酸尿等。

尿石癥的主要病因為鈣磷代謝紊亂以及其他因素。而患者對代謝紊亂方面比較關(guān)心。

具體病因可分為：

(1)胱氨酸尿：屬遺傳性缺陷。

(2)高草酸尿：原發(fā)性高草酸尿、維生素B6缺乏等。

(3)黃嘌呤尿：是常染色體隱性遺傳的嘌吟代謝紊亂。

(4)低枸櫞酸尿：堿中毒、甲旁亢、維生素D中毒、酸中毒、低鉀血癥、尿路感染。

(5)高尿酸尿：痛風、高尿酸血、高尿酸尿、白血病、真性紅細胞增多癥、先天性酶缺陷(如糖原貯疾病)、舞蹈手足徐動癥等。

(6)高鈣尿：高血鈣、甲狀旁腺功能亢進、原發(fā)性遠端腎小管酸中毒、髓質(zhì)海綿腎、類肉瘤病、維生素D中毒、乳堿綜合征、長期臥床、Cushing''''s綜合征、甲亢、特發(fā)性高鈣尿(吸收性高尿鈣)。

(7) 據(jù)科研實驗發(fā)現(xiàn)，性激素與結(jié)石癥密切相關(guān)，雄激素可以誘發(fā)結(jié)石。 醫(yī)學界一直認為，尿石癥的病因比較復雜，與自然環(huán)境、生活條件、全身代謝紊亂及本身疾患有關(guān)，且具有個性化特點。

但是，在臨床上卻發(fā)現(xiàn)尿石癥男性發(fā)病率明顯高於女性，大約為二點五比一。廣西醫(yī)科大學一附 院對四組雄性大白鼠進行了對比測試，試驗組白鼠給予百分之零點五乙二醇溶液作日常飲用水誘發(fā)結(jié)石，對照 組給予標準飲用水。

四周后分別取白鼠左心血、腎臟病理切片測性激素及觀察結(jié)石結(jié)晶，結(jié)果發(fā)現(xiàn)性激素與結(jié) 石形成有明顯關(guān)系，雄激素可以誘發(fā)結(jié)石。

此外，患者因某種病而大量服用維生素D、維生素C、皮質(zhì)激素、氨苯喋啶、四環(huán)素、阿司匹林等可引發(fā)腎結(jié)石。

潰瘍患者服用硅酸鎂可形成硅酸鹽結(jié)石。青光眼患者服用乙酰唑胺可形成磷酸鈣過飽和而引發(fā)結(jié)石。服用磺胺類藥物，由于乙酰衍生物由腎臟排泄，在酸性尿中溶解度低，所以導致有些患者形成結(jié)石。